Πρόκειται για μια επική ιστορία γεμάτη δράση. Ο Τόμας και οι τολμηροί σύντροφοί του έχουν βγει πια από τον εφιαλτικό Λαβύρινθο, αλλά βρίσκονται αντιμέτωποι με τη μεγαλύτερή τους πρόκληση μέχρι τώρα: τη μυστηριώδη και παντοδύναμη οργάνωση, γνωστή ως Τμήμα Παγκόσμιας Καταστροφής (WCKD). Ο έξω κόσμος κρέμεται από μια κλωστή και μια μοίρα χειρότερη από τον θάνατο περιμένει όλους όσοι μείνουν πίσω στην απέραντη ερημωμένη περιοχή της Πύρινη Γης. Ενώνοντας τις δυνάμεις τους με αντιστασιακούς πολεμιστές, τα μέλη της ομάδας τα βάζουν με τις κατά πολύ ανώτερες δυνάμεις του WCKD και αποκαλύπτουν τα σοκαριστικά του σχέδια.