Ένα από τα πιο χαρακτηριστικά αξιοθέατα που πρέπει οποιοσδήποτε βρίσκεται στο νησί να επισκεπτεί είναι το Λιμνοσπήλαιο της Μελισσάνης, το οποίο πήρε το όνομά του από τη νύμφη Μελισσάνη.

Το σπήλαιο βρίσκεται 2 χιλ. βορειοδυτικά της Σάμης στην Κεφαλονιά και αποτελεί ένα ξεχωριστό γεωλογικό φαινόμενο.

Ανακαλύφθηκε από τον Γιάννη Πετρόχειλο το 1951 και στην πραγματικότητα η ξεχωριστή του ομορφιά προέρχεται από το γεγονός ότι κατέρρευσε μεγάλο τμήμα της οροφής του.

Οι επισκέπτες οδηγούνται μέσα από μια τεχνητή είσοδο με σκαλοπάτια. Στο τέλος της εισόδου, υπάρχουν βάρκες στις οποίες μπορείτε να επιβιβαστείτε για να περιηγηθείτε στο σπήλαιο.

Η λίμνη έχει μήκος 160 μ. περίπου και το βάθος της κυμαίνεται από τα 10 μ. έως 40 μ.

Στο κέντρο της λίμνης υπάρχει ένα μικρό νησάκι, πάνω στο οποίο βρέθηκαν αρχαιολογικά ευρήματα που επιβεβαιώνουν τη λατρευτική λειτουργία του σπηλαίου καθώς, οι προϊστορικοί κάτοικοι λάτρευαν τον Θεό Πάνα και την παρουσία γυναικείων μορφών, τις γνωστές Νύμφες.

Οι μήνες που μπορεί κάποιος να επισκεφτεί το σπήλαιο της Μελισσάνης είναι από Μάιο μέχρι Οκτώβριο.